Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms