Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB28P51157 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB28P51157 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB28P51157 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB28P51157 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB28P51157 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB28P51157 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB28P51157 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB28P51157 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB28P51157 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB28P51157 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB28P51157 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB28P51157 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB28P51157 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB28P51157 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB28P51157 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB28P51157 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB28P51157 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB28P51157 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB28P51157 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB28P51157 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB28P51157 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB28P51157 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB28P51157 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB28P51157 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB28P51157 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB28P51157 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB28P51157 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB28P51157 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB28P51157 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB28P51157 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB28P51157 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB28P51157 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB28P51157 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB28P51157 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB28P51157 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB28P51157 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB28P51157 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB28P51157 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB28P51157 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB28P51157 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB28P51157 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB28P51157 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB28P51157 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB28P51157 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB28P51157 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB28P51157 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB28P51157 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB28P51157 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB28P51157 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB28P51157 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB28P51157 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB28P51157 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB28P51157 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB28P51157 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB28P51157 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB28P51157 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB28P51157 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB28P51157 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAB28P51157 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAB28P51157 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAB28P51157 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAB28P51157 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAB28P51157 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAB28P51157 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAB28P51157 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAB28P51157 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAB28P51157 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAB28P51157 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB28P51157 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB28P51157 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB28P51157 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB28P51157 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB28P51157 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB28P51157 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB28P51157 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB28P51157 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB28P51157 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB28P51157 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB28P51157 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB28P51157 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB28P51157 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB28P51157 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB28P51157 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB28P51157 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB28P51157 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB28P51157 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB28P51157 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB28P51157 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB28P51157 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB28P51157 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB28P51157 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB28P51157 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB28P51157 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB28P51157 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB28P51157 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB28P51157 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB28P51157 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB28P51157 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB28P51157 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms