Protein–RNA interactions for Protein: P50402

EMD, Emerin, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMDP50402 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMDP50402 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMDP50402 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMDP50402 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMDP50402 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMDP50402 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMDP50402 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMDP50402 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMDP50402 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMDP50402 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMDP50402 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMDP50402 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMDP50402 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMDP50402 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMDP50402 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMDP50402 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMDP50402 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMDP50402 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMDP50402 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMDP50402 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMDP50402 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMDP50402 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMDP50402 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMDP50402 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMDP50402 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMDP50402 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMDP50402 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMDP50402 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMDP50402 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMDP50402 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMDP50402 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMDP50402 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMDP50402 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMDP50402 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMDP50402 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMDP50402 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMDP50402 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EMDP50402 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMDP50402 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMDP50402 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMDP50402 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMDP50402 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMDP50402 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMDP50402 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMDP50402 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMDP50402 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMDP50402 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMDP50402 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMDP50402 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMDP50402 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMDP50402 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMDP50402 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMDP50402 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMDP50402 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMDP50402 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMDP50402 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMDP50402 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMDP50402 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMDP50402 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMDP50402 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMDP50402 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMDP50402 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMDP50402 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMDP50402 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMDP50402 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMDP50402 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMDP50402 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMDP50402 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMDP50402 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMDP50402 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMDP50402 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMDP50402 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMDP50402 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMDP50402 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMDP50402 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMDP50402 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EMDP50402 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EMDP50402 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EMDP50402 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMDP50402 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMDP50402 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMDP50402 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMDP50402 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMDP50402 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EMDP50402 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EMDP50402 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMDP50402 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMDP50402 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMDP50402 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMDP50402 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EMDP50402 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMDP50402 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMDP50402 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMDP50402 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMDP50402 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMDP50402 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMDP50402 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMDP50402 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMDP50402 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMDP50402 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms