Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX1P48742 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX1P48742 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX1P48742 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX1P48742 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX1P48742 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX1P48742 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX1P48742 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX1P48742 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX1P48742 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX1P48742 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX1P48742 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX1P48742 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX1P48742 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX1P48742 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX1P48742 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX1P48742 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX1P48742 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX1P48742 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX1P48742 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX1P48742 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX1P48742 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX1P48742 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX1P48742 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX1P48742 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX1P48742 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX1P48742 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX1P48742 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX1P48742 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX1P48742 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX1P48742 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX1P48742 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX1P48742 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX1P48742 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX1P48742 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX1P48742 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX1P48742 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX1P48742 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX1P48742 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX1P48742 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX1P48742 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX1P48742 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX1P48742 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX1P48742 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX1P48742 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX1P48742 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX1P48742 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX1P48742 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX1P48742 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX1P48742 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX1P48742 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX1P48742 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX1P48742 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX1P48742 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX1P48742 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX1P48742 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX1P48742 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX1P48742 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX1P48742 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX1P48742 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX1P48742 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX1P48742 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LHX1P48742 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LHX1P48742 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LHX1P48742 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LHX1P48742 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LHX1P48742 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LHX1P48742 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LHX1P48742 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LHX1P48742 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LHX1P48742 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LHX1P48742 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LHX1P48742 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LHX1P48742 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LHX1P48742 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LHX1P48742 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LHX1P48742 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LHX1P48742 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LHX1P48742 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LHX1P48742 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LHX1P48742 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LHX1P48742 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LHX1P48742 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LHX1P48742 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LHX1P48742 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LHX1P48742 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LHX1P48742 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LHX1P48742 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LHX1P48742 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LHX1P48742 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LHX1P48742 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LHX1P48742 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
LHX1P48742 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
LHX1P48742 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
LHX1P48742 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
LHX1P48742 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
LHX1P48742 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
LHX1P48742 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
LHX1P48742 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LHX1P48742 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms