Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF5P43026 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF5P43026 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF5P43026 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF5P43026 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF5P43026 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF5P43026 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF5P43026 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF5P43026 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF5P43026 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF5P43026 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF5P43026 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF5P43026 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF5P43026 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF5P43026 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF5P43026 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF5P43026 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF5P43026 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF5P43026 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF5P43026 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF5P43026 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF5P43026 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF5P43026 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF5P43026 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF5P43026 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF5P43026 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF5P43026 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF5P43026 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF5P43026 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF5P43026 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF5P43026 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF5P43026 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF5P43026 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF5P43026 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GDF5P43026 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF5P43026 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF5P43026 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF5P43026 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF5P43026 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF5P43026 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF5P43026 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF5P43026 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF5P43026 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF5P43026 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF5P43026 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF5P43026 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF5P43026 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF5P43026 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF5P43026 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF5P43026 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF5P43026 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF5P43026 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF5P43026 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF5P43026 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF5P43026 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF5P43026 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF5P43026 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF5P43026 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF5P43026 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF5P43026 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF5P43026 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF5P43026 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF5P43026 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF5P43026 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF5P43026 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF5P43026 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF5P43026 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF5P43026 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF5P43026 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF5P43026 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF5P43026 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF5P43026 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF5P43026 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF5P43026 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF5P43026 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF5P43026 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF5P43026 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF5P43026 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF5P43026 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF5P43026 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF5P43026 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF5P43026 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF5P43026 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF5P43026 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF5P43026 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF5P43026 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF5P43026 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF5P43026 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF5P43026 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF5P43026 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF5P43026 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF5P43026 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF5P43026 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF5P43026 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF5P43026 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF5P43026 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF5P43026 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF5P43026 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF5P43026 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF5P43026 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms