Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIA2P42262 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms