Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZEB1P37275 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms