Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms