Protein–RNA interactions for Protein: P35398

RORA, Nuclear receptor ROR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORAP35398 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RORAP35398 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RORAP35398 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RORAP35398 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RORAP35398 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RORAP35398 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RORAP35398 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RORAP35398 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RORAP35398 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RORAP35398 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RORAP35398 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RORAP35398 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RORAP35398 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORAP35398 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORAP35398 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORAP35398 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORAP35398 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORAP35398 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORAP35398 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORAP35398 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RORAP35398 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORAP35398 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORAP35398 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORAP35398 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORAP35398 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORAP35398 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORAP35398 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORAP35398 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORAP35398 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORAP35398 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORAP35398 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORAP35398 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORAP35398 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORAP35398 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORAP35398 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORAP35398 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORAP35398 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RORAP35398 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORAP35398 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RORAP35398 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORAP35398 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORAP35398 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORAP35398 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORAP35398 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORAP35398 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORAP35398 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RORAP35398 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RORAP35398 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORAP35398 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RORAP35398 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORAP35398 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORAP35398 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORAP35398 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORAP35398 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORAP35398 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORAP35398 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORAP35398 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORAP35398 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORAP35398 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORAP35398 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORAP35398 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORAP35398 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RORAP35398 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RORAP35398 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RORAP35398 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RORAP35398 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RORAP35398 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RORAP35398 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RORAP35398 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RORAP35398 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RORAP35398 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RORAP35398 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RORAP35398 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RORAP35398 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RORAP35398 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RORAP35398 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RORAP35398 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RORAP35398 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RORAP35398 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RORAP35398 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RORAP35398 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RORAP35398 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RORAP35398 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RORAP35398 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RORAP35398 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RORAP35398 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RORAP35398 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RORAP35398 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RORAP35398 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RORAP35398 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RORAP35398 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RORAP35398 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RORAP35398 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RORAP35398 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RORAP35398 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RORAP35398 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RORAP35398 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RORAP35398 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RORAP35398 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RORAP35398 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms