Protein–RNA interactions for Protein: P35226

BMI1, Polycomb complex protein BMI-1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMI1P35226 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BMI1P35226 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BMI1P35226 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BMI1P35226 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BMI1P35226 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BMI1P35226 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BMI1P35226 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BMI1P35226 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BMI1P35226 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BMI1P35226 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BMI1P35226 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BMI1P35226 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BMI1P35226 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BMI1P35226 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BMI1P35226 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BMI1P35226 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BMI1P35226 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BMI1P35226 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BMI1P35226 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BMI1P35226 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BMI1P35226 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BMI1P35226 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BMI1P35226 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BMI1P35226 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BMI1P35226 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BMI1P35226 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BMI1P35226 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BMI1P35226 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BMI1P35226 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BMI1P35226 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BMI1P35226 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BMI1P35226 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BMI1P35226 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BMI1P35226 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BMI1P35226 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BMI1P35226 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BMI1P35226 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BMI1P35226 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BMI1P35226 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BMI1P35226 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
BMI1P35226 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BMI1P35226 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BMI1P35226 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BMI1P35226 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BMI1P35226 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
BMI1P35226 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BMI1P35226 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BMI1P35226 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BMI1P35226 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BMI1P35226 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
BMI1P35226 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BMI1P35226 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BMI1P35226 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BMI1P35226 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BMI1P35226 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
BMI1P35226 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BMI1P35226 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BMI1P35226 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BMI1P35226 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BMI1P35226 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BMI1P35226 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BMI1P35226 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BMI1P35226 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BMI1P35226 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BMI1P35226 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BMI1P35226 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BMI1P35226 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BMI1P35226 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BMI1P35226 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BMI1P35226 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BMI1P35226 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BMI1P35226 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BMI1P35226 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
BMI1P35226 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BMI1P35226 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BMI1P35226 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BMI1P35226 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BMI1P35226 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
BMI1P35226 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
BMI1P35226 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BMI1P35226 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BMI1P35226 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BMI1P35226 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BMI1P35226 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BMI1P35226 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BMI1P35226 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BMI1P35226 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BMI1P35226 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BMI1P35226 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BMI1P35226 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BMI1P35226 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BMI1P35226 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BMI1P35226 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BMI1P35226 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BMI1P35226 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BMI1P35226 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BMI1P35226 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BMI1P35226 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BMI1P35226 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BMI1P35226 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms