Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP6P35125 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP6P35125 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP6P35125 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP6P35125 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
USP6P35125 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP6P35125 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP6P35125 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP6P35125 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP6P35125 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP6P35125 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP6P35125 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP6P35125 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP6P35125 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
USP6P35125 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP6P35125 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP6P35125 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP6P35125 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP6P35125 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP6P35125 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP6P35125 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP6P35125 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP6P35125 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP6P35125 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP6P35125 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP6P35125 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP6P35125 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP6P35125 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP6P35125 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP6P35125 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP6P35125 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP6P35125 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
USP6P35125 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP6P35125 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP6P35125 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP6P35125 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP6P35125 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP6P35125 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP6P35125 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP6P35125 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP6P35125 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP6P35125 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP6P35125 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP6P35125 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP6P35125 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP6P35125 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP6P35125 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP6P35125 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP6P35125 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP6P35125 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP6P35125 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP6P35125 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP6P35125 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP6P35125 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP6P35125 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP6P35125 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP6P35125 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP6P35125 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP6P35125 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP6P35125 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP6P35125 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP6P35125 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP6P35125 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP6P35125 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP6P35125 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP6P35125 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP6P35125 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
USP6P35125 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP6P35125 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP6P35125 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP6P35125 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP6P35125 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
USP6P35125 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
USP6P35125 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP6P35125 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP6P35125 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
USP6P35125 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
USP6P35125 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
USP6P35125 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
USP6P35125 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP6P35125 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP6P35125 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP6P35125 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP6P35125 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP6P35125 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP6P35125 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP6P35125 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP6P35125 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
USP6P35125 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP6P35125 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP6P35125 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
USP6P35125 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
USP6P35125 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP6P35125 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
USP6P35125 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
USP6P35125 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP6P35125 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP6P35125 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP6P35125 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP6P35125 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms