Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms