Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms