Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCAP28676 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCAP28676 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCAP28676 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCAP28676 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GCAP28676 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCAP28676 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCAP28676 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCAP28676 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCAP28676 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCAP28676 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCAP28676 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCAP28676 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GCAP28676 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCAP28676 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCAP28676 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GCAP28676 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCAP28676 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GCAP28676 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCAP28676 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GCAP28676 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCAP28676 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCAP28676 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCAP28676 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCAP28676 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCAP28676 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCAP28676 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCAP28676 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCAP28676 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCAP28676 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCAP28676 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCAP28676 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCAP28676 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCAP28676 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCAP28676 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCAP28676 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GCAP28676 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCAP28676 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCAP28676 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCAP28676 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCAP28676 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCAP28676 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCAP28676 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCAP28676 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCAP28676 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCAP28676 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCAP28676 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCAP28676 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCAP28676 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCAP28676 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCAP28676 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCAP28676 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCAP28676 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCAP28676 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCAP28676 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCAP28676 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCAP28676 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCAP28676 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCAP28676 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCAP28676 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCAP28676 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GCAP28676 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GCAP28676 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GCAP28676 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCAP28676 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCAP28676 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCAP28676 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCAP28676 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCAP28676 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCAP28676 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCAP28676 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCAP28676 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCAP28676 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCAP28676 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCAP28676 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCAP28676 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCAP28676 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCAP28676 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCAP28676 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCAP28676 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCAP28676 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCAP28676 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCAP28676 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCAP28676 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCAP28676 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GCAP28676 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCAP28676 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCAP28676 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCAP28676 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCAP28676 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCAP28676 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCAP28676 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCAP28676 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCAP28676 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GCAP28676 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCAP28676 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCAP28676 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCAP28676 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCAP28676 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCAP28676 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms