Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTNNA2P26232 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms