Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA3P25788 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms