Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NME1P15531 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NME1P15531 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NME1P15531 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NME1P15531 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NME1P15531 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NME1P15531 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NME1P15531 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NME1P15531 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NME1P15531 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NME1P15531 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NME1P15531 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NME1P15531 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME1P15531 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME1P15531 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME1P15531 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NME1P15531 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME1P15531 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME1P15531 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME1P15531 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME1P15531 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME1P15531 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME1P15531 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME1P15531 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME1P15531 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME1P15531 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME1P15531 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME1P15531 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME1P15531 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME1P15531 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME1P15531 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME1P15531 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME1P15531 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME1P15531 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME1P15531 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME1P15531 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME1P15531 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME1P15531 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME1P15531 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NME1P15531 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME1P15531 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME1P15531 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME1P15531 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME1P15531 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME1P15531 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME1P15531 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME1P15531 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME1P15531 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME1P15531 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME1P15531 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NME1P15531 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NME1P15531 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NME1P15531 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NME1P15531 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NME1P15531 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NME1P15531 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NME1P15531 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NME1P15531 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NME1P15531 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NME1P15531 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NME1P15531 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NME1P15531 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NME1P15531 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
NME1P15531 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NME1P15531 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NME1P15531 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NME1P15531 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NME1P15531 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NME1P15531 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NME1P15531 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NME1P15531 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NME1P15531 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NME1P15531 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NME1P15531 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NME1P15531 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NME1P15531 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NME1P15531 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NME1P15531 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NME1P15531 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME1P15531 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME1P15531 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME1P15531 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME1P15531 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME1P15531 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME1P15531 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME1P15531 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME1P15531 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME1P15531 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME1P15531 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME1P15531 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME1P15531 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME1P15531 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME1P15531 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME1P15531 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME1P15531 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME1P15531 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME1P15531 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME1P15531 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME1P15531 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME1P15531 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms