Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA1P14867 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA1P14867 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA1P14867 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA1P14867 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA1P14867 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GABRA1P14867 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA1P14867 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA1P14867 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA1P14867 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA1P14867 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA1P14867 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA1P14867 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA1P14867 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GABRA1P14867 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA1P14867 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA1P14867 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA1P14867 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA1P14867 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA1P14867 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA1P14867 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA1P14867 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA1P14867 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GABRA1P14867 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA1P14867 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA1P14867 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GABRA1P14867 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA1P14867 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA1P14867 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms