Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GP1BBP13224 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms