Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms