Protein–RNA interactions for Protein: P12270

TPR, Nucleoprotein TPR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRP12270 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TPRP12270 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPRP12270 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TPRP12270 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPRP12270 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPRP12270 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPRP12270 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TPRP12270 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPRP12270 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPRP12270 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TPRP12270 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPRP12270 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPRP12270 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPRP12270 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPRP12270 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPRP12270 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPRP12270 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPRP12270 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPRP12270 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPRP12270 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPRP12270 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPRP12270 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPRP12270 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPRP12270 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TPRP12270 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPRP12270 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TPRP12270 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TPRP12270 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPRP12270 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPRP12270 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPRP12270 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPRP12270 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPRP12270 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPRP12270 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPRP12270 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPRP12270 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPRP12270 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPRP12270 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPRP12270 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPRP12270 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPRP12270 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPRP12270 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPRP12270 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPRP12270 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPRP12270 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPRP12270 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPRP12270 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPRP12270 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPRP12270 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPRP12270 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPRP12270 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPRP12270 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPRP12270 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPRP12270 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TPRP12270 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPRP12270 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPRP12270 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPRP12270 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPRP12270 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPRP12270 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPRP12270 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPRP12270 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPRP12270 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPRP12270 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPRP12270 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPRP12270 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPRP12270 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPRP12270 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPRP12270 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPRP12270 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPRP12270 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPRP12270 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPRP12270 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPRP12270 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPRP12270 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPRP12270 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPRP12270 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPRP12270 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPRP12270 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPRP12270 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPRP12270 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPRP12270 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TPRP12270 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TPRP12270 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPRP12270 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPRP12270 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPRP12270 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPRP12270 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPRP12270 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TPRP12270 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TPRP12270 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TPRP12270 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TPRP12270 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TPRP12270 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TPRP12270 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TPRP12270 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TPRP12270 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TPRP12270 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TPRP12270 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TPRP12270 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms