Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TOP2AP11388 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TOP2AP11388 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TOP2AP11388 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TOP2AP11388 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TOP2AP11388 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TOP2AP11388 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TOP2AP11388 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TOP2AP11388 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TOP2AP11388 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TOP2AP11388 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TOP2AP11388 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TOP2AP11388 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TOP2AP11388 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TOP2AP11388 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TOP2AP11388 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TOP2AP11388 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TOP2AP11388 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TOP2AP11388 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TOP2AP11388 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TOP2AP11388 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TOP2AP11388 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TOP2AP11388 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TOP2AP11388 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TOP2AP11388 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TOP2AP11388 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TOP2AP11388 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TOP2AP11388 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TOP2AP11388 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TOP2AP11388 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms