Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGAMP11215 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms