Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms