Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms