Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYBBP04839 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYBBP04839 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYBBP04839 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYBBP04839 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYBBP04839 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CYBBP04839 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYBBP04839 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CYBBP04839 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CYBBP04839 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CYBBP04839 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYBBP04839 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYBBP04839 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYBBP04839 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYBBP04839 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYBBP04839 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYBBP04839 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYBBP04839 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYBBP04839 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYBBP04839 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYBBP04839 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYBBP04839 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYBBP04839 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYBBP04839 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYBBP04839 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYBBP04839 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYBBP04839 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYBBP04839 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYBBP04839 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYBBP04839 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYBBP04839 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYBBP04839 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYBBP04839 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CYBBP04839 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CYBBP04839 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CYBBP04839 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CYBBP04839 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CYBBP04839 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CYBBP04839 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CYBBP04839 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CYBBP04839 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYBBP04839 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYBBP04839 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYBBP04839 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYBBP04839 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYBBP04839 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYBBP04839 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYBBP04839 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYBBP04839 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYBBP04839 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CYBBP04839 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CYBBP04839 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CYBBP04839 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CYBBP04839 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CYBBP04839 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CYBBP04839 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CYBBP04839 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYBBP04839 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYBBP04839 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYBBP04839 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYBBP04839 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYBBP04839 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYBBP04839 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYBBP04839 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYBBP04839 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYBBP04839 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYBBP04839 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYBBP04839 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYBBP04839 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYBBP04839 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYBBP04839 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CYBBP04839 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYBBP04839 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYBBP04839 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CYBBP04839 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYBBP04839 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYBBP04839 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYBBP04839 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYBBP04839 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYBBP04839 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYBBP04839 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYBBP04839 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYBBP04839 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYBBP04839 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYBBP04839 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYBBP04839 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYBBP04839 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYBBP04839 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYBBP04839 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYBBP04839 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYBBP04839 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYBBP04839 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYBBP04839 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYBBP04839 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CYBBP04839 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYBBP04839 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYBBP04839 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYBBP04839 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYBBP04839 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYBBP04839 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms