Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSD2O96028 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSD2O96028 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSD2O96028 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSD2O96028 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSD2O96028 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NSD2O96028 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NSD2O96028 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSD2O96028 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSD2O96028 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSD2O96028 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSD2O96028 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSD2O96028 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NSD2O96028 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSD2O96028 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSD2O96028 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSD2O96028 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSD2O96028 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSD2O96028 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSD2O96028 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSD2O96028 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSD2O96028 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSD2O96028 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSD2O96028 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSD2O96028 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSD2O96028 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSD2O96028 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSD2O96028 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSD2O96028 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSD2O96028 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSD2O96028 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSD2O96028 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSD2O96028 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSD2O96028 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSD2O96028 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSD2O96028 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NSD2O96028 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NSD2O96028 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NSD2O96028 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NSD2O96028 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NSD2O96028 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NSD2O96028 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NSD2O96028 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NSD2O96028 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NSD2O96028 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NSD2O96028 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
NSD2O96028 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
NSD2O96028 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NSD2O96028 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NSD2O96028 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NSD2O96028 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NSD2O96028 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NSD2O96028 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NSD2O96028 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NSD2O96028 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NSD2O96028 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSD2O96028 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSD2O96028 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSD2O96028 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSD2O96028 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSD2O96028 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSD2O96028 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NSD2O96028 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSD2O96028 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSD2O96028 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSD2O96028 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSD2O96028 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSD2O96028 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSD2O96028 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSD2O96028 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSD2O96028 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSD2O96028 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSD2O96028 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSD2O96028 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSD2O96028 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSD2O96028 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSD2O96028 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NSD2O96028 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSD2O96028 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSD2O96028 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSD2O96028 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSD2O96028 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSD2O96028 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSD2O96028 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSD2O96028 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSD2O96028 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSD2O96028 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSD2O96028 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSD2O96028 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSD2O96028 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSD2O96028 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSD2O96028 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSD2O96028 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSD2O96028 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSD2O96028 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSD2O96028 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSD2O96028 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSD2O96028 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSD2O96028 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSD2O96028 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms