Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX7O95931 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX7O95931 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX7O95931 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX7O95931 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX7O95931 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX7O95931 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX7O95931 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX7O95931 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX7O95931 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX7O95931 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX7O95931 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX7O95931 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX7O95931 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX7O95931 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX7O95931 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX7O95931 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX7O95931 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX7O95931 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX7O95931 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX7O95931 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX7O95931 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX7O95931 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX7O95931 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX7O95931 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX7O95931 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX7O95931 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX7O95931 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX7O95931 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX7O95931 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX7O95931 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX7O95931 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX7O95931 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX7O95931 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX7O95931 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX7O95931 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX7O95931 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX7O95931 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX7O95931 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX7O95931 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX7O95931 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX7O95931 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX7O95931 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX7O95931 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX7O95931 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX7O95931 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX7O95931 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX7O95931 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX7O95931 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX7O95931 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX7O95931 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX7O95931 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX7O95931 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX7O95931 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX7O95931 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX7O95931 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX7O95931 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CBX7O95931 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CBX7O95931 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CBX7O95931 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CBX7O95931 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CBX7O95931 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CBX7O95931 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX7O95931 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX7O95931 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX7O95931 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX7O95931 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX7O95931 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX7O95931 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX7O95931 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX7O95931 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX7O95931 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX7O95931 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX7O95931 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX7O95931 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX7O95931 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX7O95931 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX7O95931 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX7O95931 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX7O95931 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX7O95931 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX7O95931 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX7O95931 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX7O95931 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX7O95931 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX7O95931 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX7O95931 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX7O95931 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX7O95931 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX7O95931 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX7O95931 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX7O95931 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX7O95931 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX7O95931 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX7O95931 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX7O95931 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX7O95931 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX7O95931 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX7O95931 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX7O95931 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms