Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NEBLO76041 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NEBLO76041 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NEBLO76041 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NEBLO76041 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NEBLO76041 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NEBLO76041 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NEBLO76041 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NEBLO76041 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NEBLO76041 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NEBLO76041 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NEBLO76041 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NEBLO76041 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NEBLO76041 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NEBLO76041 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NEBLO76041 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NEBLO76041 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NEBLO76041 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NEBLO76041 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NEBLO76041 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NEBLO76041 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NEBLO76041 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NEBLO76041 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NEBLO76041 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NEBLO76041 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NEBLO76041 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NEBLO76041 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NEBLO76041 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NEBLO76041 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NEBLO76041 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NEBLO76041 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NEBLO76041 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NEBLO76041 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NEBLO76041 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NEBLO76041 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NEBLO76041 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEBLO76041 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEBLO76041 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEBLO76041 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEBLO76041 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEBLO76041 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEBLO76041 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEBLO76041 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEBLO76041 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEBLO76041 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEBLO76041 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEBLO76041 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEBLO76041 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEBLO76041 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEBLO76041 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEBLO76041 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEBLO76041 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEBLO76041 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEBLO76041 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEBLO76041 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEBLO76041 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEBLO76041 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEBLO76041 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEBLO76041 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NEBLO76041 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEBLO76041 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEBLO76041 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEBLO76041 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEBLO76041 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEBLO76041 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEBLO76041 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEBLO76041 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NEBLO76041 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEBLO76041 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEBLO76041 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEBLO76041 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEBLO76041 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEBLO76041 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEBLO76041 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEBLO76041 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEBLO76041 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEBLO76041 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEBLO76041 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEBLO76041 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEBLO76041 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEBLO76041 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEBLO76041 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEBLO76041 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEBLO76041 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEBLO76041 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEBLO76041 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEBLO76041 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEBLO76041 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEBLO76041 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEBLO76041 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEBLO76041 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEBLO76041 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NEBLO76041 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEBLO76041 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEBLO76041 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEBLO76041 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NEBLO76041 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEBLO76041 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEBLO76041 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NEBLO76041 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms