Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SIN3BO75182 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms