Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms