Protein–RNA interactions for Protein: O43900

PRICKLE3, Prickle planar cell polarity protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRICKLE3O43900 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRICKLE3O43900 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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