Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1O43347 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MSI1O43347 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MSI1O43347 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MSI1O43347 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MSI1O43347 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MSI1O43347 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MSI1O43347 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MSI1O43347 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MSI1O43347 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MSI1O43347 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MSI1O43347 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MSI1O43347 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MSI1O43347 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MSI1O43347 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MSI1O43347 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MSI1O43347 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MSI1O43347 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MSI1O43347 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MSI1O43347 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MSI1O43347 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MSI1O43347 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MSI1O43347 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MSI1O43347 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MSI1O43347 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MSI1O43347 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MSI1O43347 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MSI1O43347 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MSI1O43347 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MSI1O43347 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MSI1O43347 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MSI1O43347 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MSI1O43347 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MSI1O43347 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MSI1O43347 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MSI1O43347 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MSI1O43347 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MSI1O43347 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MSI1O43347 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MSI1O43347 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MSI1O43347 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MSI1O43347 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MSI1O43347 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MSI1O43347 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MSI1O43347 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MSI1O43347 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MSI1O43347 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MSI1O43347 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MSI1O43347 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MSI1O43347 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MSI1O43347 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MSI1O43347 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MSI1O43347 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MSI1O43347 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MSI1O43347 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MSI1O43347 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MSI1O43347 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MSI1O43347 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MSI1O43347 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MSI1O43347 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MSI1O43347 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MSI1O43347 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MSI1O43347 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MSI1O43347 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MSI1O43347 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MSI1O43347 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MSI1O43347 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MSI1O43347 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MSI1O43347 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MSI1O43347 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MSI1O43347 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MSI1O43347 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MSI1O43347 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MSI1O43347 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MSI1O43347 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MSI1O43347 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MSI1O43347 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MSI1O43347 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MSI1O43347 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MSI1O43347 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MSI1O43347 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MSI1O43347 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MSI1O43347 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MSI1O43347 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MSI1O43347 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MSI1O43347 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MSI1O43347 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MSI1O43347 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MSI1O43347 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MSI1O43347 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MSI1O43347 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MSI1O43347 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MSI1O43347 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MSI1O43347 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MSI1O43347 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MSI1O43347 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MSI1O43347 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MSI1O43347 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MSI1O43347 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MSI1O43347 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MSI1O43347 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms