Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNMO15061 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNMO15061 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNMO15061 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNMO15061 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNMO15061 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNMO15061 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNMO15061 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNMO15061 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNMO15061 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNMO15061 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNMO15061 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNMO15061 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNMO15061 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNMO15061 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNMO15061 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNMO15061 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNMO15061 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNMO15061 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNMO15061 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNMO15061 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNMO15061 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNMO15061 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNMO15061 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNMO15061 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNMO15061 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNMO15061 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNMO15061 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNMO15061 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNMO15061 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNMO15061 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNMO15061 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNMO15061 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNMO15061 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNMO15061 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNMO15061 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNMO15061 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNMO15061 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNMO15061 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNMO15061 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNMO15061 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNMO15061 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNMO15061 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNMO15061 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNMO15061 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNMO15061 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNMO15061 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNMO15061 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNMO15061 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNMO15061 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNMO15061 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNMO15061 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNMO15061 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNMO15061 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNMO15061 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNMO15061 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNMO15061 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNMO15061 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNMO15061 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNMO15061 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNMO15061 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNMO15061 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNMO15061 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNMO15061 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNMO15061 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNMO15061 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNMO15061 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNMO15061 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNMO15061 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNMO15061 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNMO15061 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNMO15061 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNMO15061 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNMO15061 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNMO15061 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNMO15061 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNMO15061 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNMO15061 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNMO15061 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SYNMO15061 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SYNMO15061 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SYNMO15061 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SYNMO15061 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNMO15061 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNMO15061 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNMO15061 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNMO15061 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNMO15061 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNMO15061 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNMO15061 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNMO15061 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNMO15061 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNMO15061 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNMO15061 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNMO15061 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNMO15061 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNMO15061 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNMO15061 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNMO15061 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNMO15061 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms