Protein–RNA interactions for Protein: O14562

UBFD1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBFD1O14562 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBFD1O14562 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBFD1O14562 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBFD1O14562 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBFD1O14562 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBFD1O14562 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBFD1O14562 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
UBFD1O14562 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBFD1O14562 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBFD1O14562 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBFD1O14562 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBFD1O14562 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBFD1O14562 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBFD1O14562 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBFD1O14562 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBFD1O14562 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBFD1O14562 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBFD1O14562 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBFD1O14562 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBFD1O14562 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBFD1O14562 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBFD1O14562 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UBFD1O14562 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBFD1O14562 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBFD1O14562 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBFD1O14562 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBFD1O14562 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBFD1O14562 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBFD1O14562 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBFD1O14562 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBFD1O14562 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBFD1O14562 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBFD1O14562 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UBFD1O14562 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBFD1O14562 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UBFD1O14562 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBFD1O14562 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBFD1O14562 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBFD1O14562 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UBFD1O14562 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UBFD1O14562 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBFD1O14562 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBFD1O14562 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UBFD1O14562 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBFD1O14562 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBFD1O14562 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBFD1O14562 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBFD1O14562 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBFD1O14562 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBFD1O14562 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBFD1O14562 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBFD1O14562 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBFD1O14562 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBFD1O14562 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBFD1O14562 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBFD1O14562 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBFD1O14562 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBFD1O14562 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBFD1O14562 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBFD1O14562 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBFD1O14562 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBFD1O14562 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBFD1O14562 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBFD1O14562 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBFD1O14562 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBFD1O14562 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBFD1O14562 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UBFD1O14562 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBFD1O14562 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBFD1O14562 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBFD1O14562 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBFD1O14562 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBFD1O14562 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBFD1O14562 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBFD1O14562 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBFD1O14562 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBFD1O14562 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBFD1O14562 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBFD1O14562 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBFD1O14562 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBFD1O14562 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBFD1O14562 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBFD1O14562 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBFD1O14562 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBFD1O14562 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBFD1O14562 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBFD1O14562 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBFD1O14562 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBFD1O14562 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBFD1O14562 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UBFD1O14562 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBFD1O14562 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBFD1O14562 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBFD1O14562 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBFD1O14562 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UBFD1O14562 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBFD1O14562 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBFD1O14562 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBFD1O14562 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBFD1O14562 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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