Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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