Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms