Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF839A8K0R7 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms