Protein–RNA interactions for Protein: A6NMD2

GOLGA8J, Golgin subfamily A member 8J, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8JA6NMD2 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA8JA6NMD2 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms