Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms