Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEMP2A6NFY4 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms