Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX8Q9Y5X2 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms