Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAF6Q9Y4K3 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms