Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC10.73□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC10.73□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC10.72□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.72□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC10.72□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC10.72□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms