Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAB39Q9Y376 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms