Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms