Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP8AP2Q9UKL3 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP8AP2Q9UKL3 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms