Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIG8

SLCO3A1, Solute carrier organic anion transporter family member 3A1, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO3A1Q9UIG8 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLCO3A1Q9UIG8 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms