Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.05■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.05■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MED13Q9UHV7 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MED13Q9UHV7 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MED13Q9UHV7 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MED13Q9UHV7 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MED13Q9UHV7 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MED13Q9UHV7 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MED13Q9UHV7 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MED13Q9UHV7 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MED13Q9UHV7 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MED13Q9UHV7 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MED13Q9UHV7 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MED13Q9UHV7 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
MED13Q9UHV7 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MED13Q9UHV7 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MED13Q9UHV7 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MED13Q9UHV7 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MED13Q9UHV7 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MED13Q9UHV7 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MED13Q9UHV7 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MED13Q9UHV7 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MED13Q9UHV7 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MED13Q9UHV7 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MED13Q9UHV7 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MED13Q9UHV7 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MED13Q9UHV7 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MED13Q9UHV7 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MED13Q9UHV7 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MED13Q9UHV7 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MED13Q9UHV7 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MED13Q9UHV7 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MED13Q9UHV7 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MED13Q9UHV7 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MED13Q9UHV7 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MED13Q9UHV7 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MED13Q9UHV7 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MED13Q9UHV7 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
MED13Q9UHV7 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MED13Q9UHV7 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MED13Q9UHV7 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MED13Q9UHV7 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MED13Q9UHV7 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MED13Q9UHV7 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MED13Q9UHV7 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MED13Q9UHV7 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MED13Q9UHV7 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms