Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
POLKQ9UBT6 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms